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簡要描述:臨床基因擴(kuò)增實驗又稱 PCR實驗,是專門用來檢驗艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病的一種檢測手段。它可以通過將病毒體內(nèi)所含的基因進(jìn)行擴(kuò)增的方法,測出一些病毒含量不高的感染者體內(nèi)是否含有特定的病毒。PCR實驗室裝修-規(guī)劃設(shè)計
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
PCR實驗室裝修-規(guī)劃設(shè)計
一、 PCR實驗室改造平面布局
臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。
各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應(yīng)通過傳遞窗進(jìn)行。
二、PCR實驗室空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)計及壓力控制
PCR實驗室并沒有嚴(yán)格的凈化要求,但是為避免各個實驗區(qū)域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,要嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實驗區(qū)的壓力要求。
1、試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)
該實驗區(qū)主要進(jìn)行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。試劑和用于標(biāo)本制作的材料應(yīng)直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。
對與氣流壓力的控制,本區(qū)并沒有嚴(yán)格的要求。
2、標(biāo)本制備區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為臨床標(biāo)本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管和測定RNA時cDNA的合成。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
3、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為DNA或 cDNA擴(kuò)增。此外,已制備的DNA模板和合成的 cDNA(來自樣本制備區(qū)) 的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū)) 制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。在巢式 PCR測定中,通常在di一輪擴(kuò)增后必須打開反應(yīng)管,因此巢式擴(kuò)增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負(fù)壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺內(nèi)進(jìn)行。
4、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為擴(kuò)增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區(qū)域可不設(shè)。
本區(qū)是主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負(fù)壓,以避免擴(kuò)增產(chǎn)物從本區(qū)擴(kuò)散至其它區(qū)域。
三、PCR實驗室設(shè)計關(guān)于污染的預(yù)防與控制
PCR實驗室設(shè)計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結(jié)果必須作廢,需重新進(jìn)行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。
1、工作區(qū)域的嚴(yán)格劃分
(1)各個實驗區(qū)域設(shè)置合理;
(2)各個實驗區(qū)域要有明顯的標(biāo)記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等),以避免各個不同實驗區(qū)域設(shè)備物品、試劑等發(fā)生混淆。
2、合理的系統(tǒng)設(shè)置
(1)合理的空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)置,盡量采用全送全排的空調(diào)系統(tǒng);
(2)嚴(yán)格的氣流壓力控制,保證不同的實驗區(qū)內(nèi)不同的壓力要求。
3、規(guī)范的操作
(1)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室的技術(shù)人員必須進(jìn)行上崗培訓(xùn),經(jīng)培訓(xùn)合格后才能從事臨床基因擴(kuò)增檢驗的工作;
(2)在實驗操作過程中,操作者必須戴手套,并經(jīng)常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個有效地防止污染的措施;
(3)清潔工作及時、正確。實驗工作結(jié)束后,必須立即對本區(qū)進(jìn)行清潔。除常規(guī)的消毒液體對表面進(jìn)行擦拭消毒或紫外線燈的照射消毒外,對一些實驗設(shè)備還應(yīng)進(jìn)行高壓消毒處理。
4、嚴(yán)格的管理
(1)嚴(yán)格控制進(jìn)出實驗室的人員。與實驗無關(guān)的人員不得隨意進(jìn)出實驗室,有條件的情況下要設(shè)置獨立的通道和進(jìn)出整個實驗區(qū)的門;
(2)在各個實驗區(qū)域使用帶有明顯區(qū)別標(biāo)志的工作服(如不同顏色),當(dāng)工作人員離開時不得將本區(qū)的工作服帶至其它區(qū)域;
(3)盡量減少在實驗區(qū)內(nèi)不必要的走動以減少交叉污染的可能性。
(4)擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)是主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來源,廢液不能在實驗室中傾倒,必須經(jīng)消毒液浸泡消毒后在遠(yuǎn)離實驗室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應(yīng)經(jīng)消毒液浸泡消毒后統(tǒng)一處理,如焚燒等;
(5)擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可能會用到某些可致基因突變和有毒物質(zhì),應(yīng)特別注意實驗人員的安全防護(hù)。
5、完備的實驗室配套設(shè)施
完備的實驗室配套設(shè)施是保證實驗工作的必要條件,應(yīng)根據(jù)各個實驗室實驗內(nèi)容的不同配備相應(yīng)的設(shè)備和儀器,如超凈工作臺、離心機(jī)、加樣器等。
PCR實驗室裝修-規(guī)劃設(shè)計
PCR病毒核酸檢測實驗室在近的新型肺炎病毒防控中起到重要作用。為了防止交叉污染,緩沖間和核心工作間一定要設(shè)置為負(fù)壓,清潔區(qū)則設(shè)置為常壓。對PCR實驗室的各實驗房間壓差控制一定要嚴(yán)格處理,尤其是基因擴(kuò)增和產(chǎn)物區(qū)的氣流不能互相串通,以免引起檢測提取數(shù)據(jù)的重疊失效。
一、無菌潔凈間的壓差控制重要性
對于無菌負(fù)壓潔凈間我們經(jīng)常會碰到塵埃粒子檢測不達(dá)標(biāo)的問題,SAREN經(jīng)過多次的現(xiàn)場考察和多年的檢測技術(shù)經(jīng)驗可以得出以下兩個問題:塵埃粒子問題,房間的負(fù)壓設(shè)定值越高其潔凈難度也就會越高,對于我們施工的工藝要求也就越高,顧名思義負(fù)壓潔凈間的大氣壓要比室外空氣大氣壓力低,潔凈間根據(jù)要求設(shè)計負(fù)壓值越高,相對室外大氣壓值就會相差越大,如果施工工藝不到位就會導(dǎo)致負(fù)壓潔凈間的墻壁接縫,照明燈具電源線孔,吊頂板材開孔的高翔箱體縫隙,墻壁開孔的強(qiáng)弱電插座即插座孔等都是室外非經(jīng)過處理的氣壓空氣進(jìn)入負(fù)壓潔凈間的路徑,從而導(dǎo)致負(fù)壓潔凈間的塵埃粒子超標(biāo)的現(xiàn)象。
負(fù)壓潔凈間的潔凈級別和緩沖間潔凈級別應(yīng)一致或更高,緩沖間和負(fù)壓間的潔凈級別一致或更高級別后負(fù)壓潔凈間的潔凈氣體才會一致,潔凈級別才會有保障。
二、實驗室壓差控制的原理
根據(jù)PCR操作流程方向,試劑準(zhǔn)備,標(biāo)準(zhǔn)制備,擴(kuò)增區(qū),產(chǎn)物分析區(qū)。相對壓差也應(yīng)從試劑準(zhǔn)備至產(chǎn)物分析方向由高到低的過程。不過在實際的使用調(diào)劑過程中我們會遇到緩沖的氣壓很難調(diào)到設(shè)定值,若擴(kuò)增和產(chǎn)物緩沖區(qū)的—5~—10Pa,在調(diào)試過程中會出現(xiàn)壓差不平衡的問題,比如潔走廊往緩沖方向流入緩沖就是小負(fù)壓室,緩沖再被動流入負(fù)壓內(nèi)室就應(yīng)變?yōu)檎龎?,從而緩沖間排風(fēng)大于送風(fēng)量,也就是送風(fēng)設(shè)置為關(guān)閉狀態(tài)后基本可以實現(xiàn)負(fù)壓的設(shè)定值,因此關(guān)閉送風(fēng)維持負(fù)壓狀態(tài)是不可行的。
其實我們只要了解PCR關(guān)鍵性能后也可以取另外的方式來實現(xiàn)氣流合理性的控制,比如PCR緩沖間理解為第二氣閥室(室內(nèi)與緩沖間是兩層隔離屏障,潔凈走廊對外是di一層屏障),所以緩沖間的設(shè)置為相對或者的正壓值是很有必要也是符合使用標(biāo)準(zhǔn)的。
三、PCR實驗室功能區(qū)的壓力控制標(biāo)準(zhǔn)
① 壓力梯度-好在10Pa及以上
② 兩種控制方式:系統(tǒng)控制和排風(fēng)功率變化。系統(tǒng)控制即4個房間的壓力控制應(yīng)同時啟停;排風(fēng)控制即排風(fēng)管道應(yīng)分支,否則實驗室停運時風(fēng)流倒灌,造成污染。
③ 試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓,以防外界含核酸氣溶膠的空氣進(jìn)入,造成污染;可以通過控制進(jìn)風(fēng)風(fēng)量大于排風(fēng)風(fēng)量達(dá)到正壓效果。
④ 核酸擴(kuò)增室及產(chǎn)物分析室應(yīng)呈微負(fù)壓,以防含核酸的氣溶膠擴(kuò)散出去污染試劑與樣品,可以通過控制排風(fēng)風(fēng)量大于進(jìn)風(fēng)風(fēng)量達(dá)到負(fù)壓效果。
⑤ 在理想情況下,PCR實驗室緩沖間內(nèi),可設(shè)置正壓,使室內(nèi)空氣不流向室外,室外空氣不流向室內(nèi)。PCR實驗室進(jìn)風(fēng)由原有中央空調(diào)控制,要求將中央空調(diào)風(fēng)口安裝到定點,且高度為地面鋪裝好后2600mm處。
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